个人转让股权，按“财产转让所得”缴纳个人所得税，应纳税额 = （股权转让收入–股权原值–合理费用） × 20%。
注意：个人股东以分期收款方式转让股权，不能分期缴纳个人所得税，应当将整个股权转让行为视为一次，一次性计缴个人所得税。纳税人转让股权的印花税计税依据，按照产权转移书据所列的金额（不包括列明的认缴后尚未实际出资权益部分）确定。产权转移书据，税率为价款的万分之五。个人转让所持有的非上市公司股权，不需要缴纳增值税。合理费用是指股权转让时按照规定支付的有关税费。比如印花税，评估费等。三、股权转让收入就是买卖双方签订转让合同上标明的转让价？不完全是。一般情况下是转让合同上标明的价格，但也有例外的情况，比如转让价格明显偏低且没有合理理由，税务机关会核定征收；再比如转让人除了取得合同标明的股权转让收入之外，还有一些合同未列明但与转让股权相关的收入，也应当一并征税。股权转让收入是指转让方因股权转让而获得的现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益。
2、通常情况下股权转让收入可以根据股权转让协议据实确认，但有时候其他与股权转让相关的收益也要一并计算征税。同时，也存在主管税务机关核定收入的情形，以下表列式。
股权转让收入应当按照公平交易原则确定。符合下列情形之一，视为股权转让收入明显偏低:（一）申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额的。其中，被投资企业拥有土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产的，申报的股权转让收入低于股权对应的净资产公允价值份额的；（二）申报的股权转让收入低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的；（三）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让收入的；（四）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让收入的；六、只要股权转让收入明显偏低就会被税务机关调整吗？不完全是。如果符合下列条件之一，即使收入偏低也视为有正当理由，税务机关不会调整。（一）能出具有效文件，证明被投资企业因国家政策调整，生产经营受到重大影响，导致低价转让股权；（二）继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；（三）相关法律、政府文件或企业章程规定，并有相关资料充分证明转让价格合理且真实的本企业员工持有的不能对外转让股权的内部转让；（四）股权转让双方能够提供有效证据证明其合理性的其他合理情形。首要的，也是最主要的核定方法就是“净资产核定法”。也就是股权转让收入按照每股净资产或股权对应的净资产份额核定。如果被投资企业的土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产占企业总资产比例超过20%的，主管税务机关可参照纳税人提供的具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告核定股权转让收入。举例来说，如果被转让企业的净资产是2000万元，个人股东转让50%的股份，转让合同价格是800万元，税务机关是不认可的，需要按1000万元核定转让收入。另外如果该企业的资产总额中房屋的比例是30%，那么还需要参考中介机构出具的评估价，很可能评估价大于入账价，如果按评估价算下来企业净资产是3000万元，那么转让50%的股份，转让收入会核定为1500万元。个人股东转让公司股权（非上市），股权原值的确认标准如表所示：
注①通过无偿让渡方式取得股权，股权转让收入明显偏低，视为有正当理由的情形，继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人。对个人多次取得同一被投资企业股权的，转让部分股权时，采用“加权平均法”确定其股权原值。举例：A公司的个人股东张三将其持有的A公司股权转让给李四，转让价是3200万元，已办理工商登记。如果税务局认为价格不公允，调整计税价为10000万元。问：李四以后再卖A公司股权，计算个税时，如果不考虑合理费用，成本是按当时购买股权时支付的股价3200万元扣除，还是按照计税价10000万元扣除？答复：股权转让人已被主管税务机关核定股权转让收入并依法征收个人所得税的，该股权受让人的股权原值以取得股权时发生的合理税费与股权转让人被主管税务机关核定的股权转让收入之和确认。应该按10000万元扣除。
个人股东转让公司股权（非上市），具有上述列表情形之一的，纳税人、扣缴义务人应当依法在次月15日内向主管税务机关申报缴纳个人所得税。请注意：上述任何一个条件符合均构成个人所得税的纳税义务发生时间。请注意：纳税地点不是纳税人所在地，也不是扣缴义务人所在地，而是被投资企业所在地的税务机关。
